Sáminuorra drivs av sina medlemmar genom förbundsstyrelsen., som består av förbundsordförande samt 16 ledamöter.
Sáminuorras kansli finns i Jokkmokk. Kansliet koordinerar Sáminuorras verksamhet, kontakter och projekt.
Sáminuorra bedriver lokal verksamhet genom sina lokalföreningar. Dessa antar Sáminuorras stadgar och drivs av engagerade medlemmar.